货运代理不同于普通货物运输。普通货物运输通常只需要安全地将货物运输到目的地。然而，货运代理涉及跨境业务，需要包装、联系海运、保险等。业务烦琐，各个环节都需要付费，所以货运代理的成本相对较高。
一般费用一般包括：
委托方应向货运代理人支付货物运输、保管、保险、报关、签证、发票等费用，并向货运代理人支付因货物运输代理人无法控制而无法履行的其他费用。货物消失或损坏属于保险人承包范围内，货运代理人赔偿后，从货物所有者那里取得代位索赔权，从其他负责人那里得到补偿或偿还。货运代理人赔偿货物后，货物所有权由货运代理人所有。
一般海运相关货运费包括：
1.海运费一般用美元，但也要看具体情况。比如客户在中国有办事处或者分公司，办事处或者分公司按照人民币结算；
2.集装箱拖车费用；
3.码头费/THC(一般东南亚。中东。印度半岛码头费)；ORC:码头费(一般欧洲)。中南美洲。非洲码头费)华南地区码头费是这样区分的；
4.订舱费；
5.报关费；
6.文件费用；
7.出具商检凭证；
8.紧急燃料附加费EBS；
9.集装箱不平衡附加CIC；
10.安全费用；
11.提单电放；
12.设备管理费；
13.海运保险费。
货代空运费用。
1.航空运输费(航空公司收取)
2.Fuelsurcharge燃料附加费(根据机场，目的点价格不同，香港目前一般在4元左右，以前是3.6元，去年最高是4.8元，这个价格由机场调整，一般去亚洲是2元)
3.安全费用(香港收取1元/公斤固定费用)
4.机场营运费用(香港是HKD283/机票，机场运送飞机等)
5.终端费用：1.72/kg交货给庄家时，庄家负责打板等，最终由机场收取）。
6.航空单据费用:HKD15/bl为提单费用-物权证明书。
就是说，货款费用范围广，费用项目多，各国标准不同。支付货款时，托运人提前支付所有费用，货物到达后支付，但需要支付一定的押金。对托运人来说，先支付押金，货物到达后支付最后一笔款项的方式比较保险。